第13集

加百利从囚禁他的囚室里逃了出来，然后去救他所有的船员，准备跟他们一起重新夺回帝国。加百利先去医务舱，准备把平行宇宙中的那个保罗带走，没想到保罗却不在那里。加百利没有看到保罗，以为保罗逃了，结果让他发现隐身的保罗，将保罗给逮捕了。乔知道了加百利开始叛乱计划，她正等着收拾加百利，而迈克则觉得乔容易受到加百利的影响，想让乔听从自己的计划，让自己参与进去。乔不接受迈克的说法，要将迈克关禁闭室，迈克无奈只好在被关之时反抗，从守卫中抢了枪逃跑，但乔还是没有放弃活抓加百利的想法。保罗恢复了正常，他努力想要挽救发现号上的菌丝体作物，可已经无能为力了，而他更担心平行宇宙中自己的另一个副本，已被菌丝网络所污染，因为这会带来灾难性的后果。加百利控制了保罗，让保罗通过广播传达他的意思，提醒所有人追随他反抗乔，同时保证迈克的安全，因为迈克是他们成就帝国新辉煌的关键。乔通过广播，找到了主播室里的加百利，于是带人前往捉拿加百利。加百利想要对付前来的乔，却发现他们有护体墙挡着动不了，在保罗的帮忙下，加百利攻破了那道墙，然后投了一个闪光弹，乔他们这才离开。迈克想尽办法，终于跟发现号取得了联系，把加百利属于人族，并且有预谋地利用了他们跃进了这个宇宙的事情如实告诉萨鲁，保罗这才明白上次跃进的数据被加百利篡改了，所以他们才没有在星际46号基地停靠。加百利在利用完保罗之后，将保罗推进了菌丝网络核心毁灭，因为保罗的存活给他构成的威胁太大。加百利借着通话寻找迈克的下落，利用通话分散迈克的注意力，让兰德里去逮捕迈克。兰德里追到迈克所在之处时，才知道迈克使用了变更了信号载体，早已经不在原地了。迈克去找乔，说明两个宇宙中的她都背叛了乔，但她不会再让这样的事情发生，她会帮乔阻止加百利。乔不相信迈克的话，认为迈克所说的，正如她对加百利那么重要一样，都是被迈克给迷惑了。迈克极力为自己解释，让乔相信她是帮助乔的，乔这才问迈克的计划。迈克带着乔去见加百利，说明加百利必须处死乔，他才能将皇位坐稳，而她的目的只有一个，就是用自己换回自己的船员，所以她要求加百利放发现号安全离开，她就留下来。提利在与保罗的共同研究下，终于想到了一个突发奇想，带发现号离开的办法。提利把这个想法告诉保罗之时，保罗突然明白，他可以反向设置坐标路线，这样便能带发现号离开。加百利联系了萨鲁，将迈克的意思告诉萨鲁，而迈克则在通话的时候，偷袭加百利的人，让萨鲁朝帝国开火，给了迈克他们可趁之机。迈克与乔联手对付加百利，乔被加百利步步紧逼，几乎打不过加百利。迈克解决了兰德里，帮助乔对付加百利，因为加百利不能杀迈克，让迈克占尽了上风。在加百利败于迈克之时，他认定迈克不敢杀他，没想到乔却在背后刺死了加百利。迈克虽然取得了成功，但发现号并不能锁定她的位置，无法及时将她传送回来，而此时加百利的人又闯进来了。乔是一个战败的皇帝，她必须拼死最后一战，迈克不能让乔死，于是在乔打斗之时，联系了发现号，在关键时刻将乔一起传送回发现号。迈克平安归来后，萨鲁他们便开始对帝国展开攻击，而此时保罗正在启用提利的构想，想利用孢子引擎将他们带离这个平行宇宙。在寇波的帮助下，保罗终于找到了方法，带着发现号驶离了平行宇宙，可时间却显示，他们限在阿尔法现象里已经超前9个月了。萨鲁让人通知星际联盟他们回来了，同时更新地图，可没想到地图却显示，这场战争中克林贡人取得了胜利。